纹美瞳线的时候可能会对眼睛造成伤害，由于美瞳线的机器速度比较快，而纹美瞳线现在用的针也很尖锐，所以很容易会对眼睛造成损伤。半永久的纹绣是从纹身改进而来的，是使用纹绣机器将染料注入到皮肤表层，让皮肤产生有色的状态，这样是个手术，但只要是手术就会有危险，不管是手术的大小。
因为这个机器速度过快而用的针线是比较尖锐，如果操作者比较粗心大意，没有安置好会导致脱落，这样很容易会对眼睛造成伤害。纹美瞳线有可能会造成交叉感染，如果使用的针线没有消毒，这样就是不合格的或者反复用同一套纹绣针，很容易会造成交叉感染，因为类似肝炎，艾滋病都是通过这样去传播的，或者是血液传播。
纹美瞳线后效果不理想，纹完美瞳线之后两只眼睛的眼线不对称或者是形状怪异，这个是由于医生的技术不过关引起来的，做完手术之后就必须选择激光去除，这必然又得去浪费金钱，还有手术的风险。
纹美瞳线会引起眼部红肿，是对皮肤表层有一定的创伤，而眼部又是特别敏感脆弱的皮肤组织，通常手术之后会引起眼部红肿，那么恢复的时间就不固定了，需要3~5天的恢复期，有的时候，甚至是会超过5天。