佐助最终是好人，但是他在期间有过叛忍的身份，可以说宇智波佐助是贯穿火影主线剧情的关键人物。
佐助一开始是第七班的，跟鸣人和小樱一起执行任务，本来一开始想着复仇哥哥，但是和鸣人小樱相处了一段时间后变得温柔起来，逐渐对复仇这件事也忘记了。中忍考试过后宇智波鼬来到木叶村，佐助的性格开始转变。
佐助首先是看到了哥哥和鸣人的强大，感觉自己太弱小，于是想过去找大蛇丸寻求力量，这也是他主动出村，在随后的剧情中，佐助先杀死了鼬，又杀死了宇智波的仇人团藏，彻底成为了叛忍。
在第四次忍界大战中，佐助明白了自己要做的事情，和鸣人一起封印了大筒木辉夜，并解开了无限月读，最终也是和小樱在一起。