美瞳比隐形眼镜更厚，透气性差，经常佩戴会降低眼球的新陈代谢和抵抗力，造成眼疲劳、眼干涩和视力模糊等现象，时间久了还会损伤眼角膜。
经常佩戴美瞳，眼球中的蛋白质会沾到美瞳上，美瞳本身透气性就差，再遇到蛋白质的侵蚀，镜片老化，透气性就会下降，眼球接触空气量减少，就会产生类似高原反应的情况，无法正常代谢，抵抗力下降。
美瞳会吸附眼睛中蛋白质、脂质和胶原等东西，沉积在镜片表面，时间久了会滋生细菌，导致角膜水肿、角膜新生血管反应和过敏反应等。
质量差的美瞳会磨损眼睛，导致视力下降等危害，而且美瞳和隐形眼镜怕高温，怕冲撞，容易碎到眼睛中，一但碎了极容易伤害眼睛，严重的会导致失明。
美瞳并不是每人都能佩戴的，有角膜炎、结膜炎、青光眼、沙眼或泪水分泌异常的人都不可以佩戴，感冒和发烧的时候最好把美瞳摘下来，以免误伤。
使用美瞳的时候要注意清洁，定期清洗美瞳，要使用专业的护理液进行浸泡和清洗，美瞳变干后不能继续使用，而且尽量使用年抛或半年抛的美瞳，日抛和月抛的质量不如年抛的好。