《赛文奥特曼》的结局是团打完怪兽后回到了M78星云。最后的结局还是让人感觉比较欣慰的，团的伤势在精心治疗下总算是稳定下来了，但是他的身体还没有恢复以前的能力。因为受了重伤，团也不能继续打怪兽了，队友们终于知道了团的真正身份是奥特曼，在打完最后一次怪兽之后团回到了M78星云。
团虽然受到了重伤，但是他并不想做x光，所以就逃走了。因为一旦照了x光，团的真实身份就会暴露。团并不想让自己的身份曝光，所以就趁人不备离开了基地。团在收音机里听到了新的战斗即将开始，虽然他的身体还没有恢复健康，但还是想去参加战斗。
很多城市在这次战斗中灰飞烟灭，邪恶势力发出了最后的通牒，马上就要准备攻占东京。在最后的30分钟里，来自M78星云的赛文奥特曼勇敢地与邪恶势力作斗争。团终于告诉了众人自己并不是人类，而是赛文奥特曼。在最后的关头，团变成了赛文奥特曼，用全身的力气引爆了整个基地。
众人终于知道赛文奥特曼就是团，他也是从M78星云来的和平使者。为了保卫地球，团作出了勇敢的战斗，当地球保卫战结束之后，团就回到了自己的星球。赛文奥特曼虽然离开了，但是人类已经有了足够的勇气来守护自己的地球了。