《盗墓笔记》中最大的谜团主要是终极的秘密和小哥的身世，其实二者是一个问题，都是由长生秘密衍生出来的，真假三叔、齐羽等故事线都以终极为主，因为觊觎长生做了手脚，导致了长达数千年的错误。
按照时间线来讲，很久很久之前，外星球有块陨石（也可以说是飞行器）坠落地球，外星生物也就是所谓的“伏羲氏”，当时伏羲氏已经掌握了长生的秘密，并在地球上繁衍生息。
伏羲氏族人都是人首蛇身，平均寿命超过一千年，但大约四千年前，伏羲氏文明衰落，族人失去长生秘密变回普通人，伏羲氏后人根据前人记载研究永生。
西王母利用鸡冠蛇、陨玉和尸蟞完成永生，但需要待在陨玉中不能离开，西王母带走了所有鸡冠蛇把自己囚禁在西王母宫中。万奴王用蚰蜒实验长生，但失败后变成了十二只手的怪物，只能生活在云顶天宫的青铜门两边。
万奴王为守护终极秘密创造了长寿的张家，让张家世代守护终极秘密，可西王母爱上凡人泄露了长生秘密，得到鬼玺和玉佣死亡鲁殇王名震一时，后来又出现了利用蛇眉铜鱼记录万奴王永生秘密的汪藏海。
汪藏海利用万奴王和西王母的永生秘密复活自己，设下圈套和陷阱，创造了汪家和张家作对，企图复活自己，消灭张家和老九门，而小哥进入青铜门是想消灭万奴王终结永生秘密，也是想终结张汪两家长达上千年的纠缠。