《雷神3》片尾有两个彩蛋。
第一个彩蛋：锤哥带着自己星球的人民坐着飞船离开了阿斯加德，当洛基还在跟雷神索尔商量着去地球的事情的时候，突然在自己飞船的身后出现了一条更大的飞船，随后彩蛋结束。这是漫威第一阶段最终大boss灭霸的飞船，灭霸在漫威漫画里可是一个超强的反派，他可以轻松打败美队等人。至于为什么灭霸会找到索尔他们的飞船，有网友分析，是因为洛基在该片中拿走了宇宙魔方（片中有预示，在洛基烧毁火人头盔时看了一眼宇宙魔方），然后灭霸有探测到魔方的能力，所以就追随而来。此彩蛋紧接着《复仇者联盟3》的剧情。
第二个彩蛋：索尔到了萨尔星球，被当做了用来打斗的玩物，但是最终还是带领着囚犯们逃了出来，片尾第二个彩蛋就是说的高天尊在自己的飞船掉下来，然后发现萨尔星球已经被囚犯解放了，于是自嘲了一番。