《无间道》的结局有两个版本，港版的结局是刘德华出电梯后表明自己的警察身份，继续做他的“卧底”。而大陆版的结局是刘德华出电梯后被立即逮捕，沦为阶下囚。
而且，最后真警察陈永仁却死去了，而且是死不瞑目。这种结局十分的悲惨，真警察死去，而假警察长存。陈永仁牺牲了，大家为他而惋惜，其身份在死后也被证实，他得到了最后的解脱。而刘建明最后在陈永仁的墓碑面前站定，敬礼，一身高级警官的制服，虽英气逼人，但眼神里幷没有丝毫的得意。
他看到的是一个曾经和自己一样身处无间地狱的人，只有陈永仁才最能了解是非难辨，身份错乱的痛苦。除了惋惜，感慨，刘建明的眼神里更多的是敬佩！这是港版中的结局，刘建明还在继续做他的“卧底”。
“凡被打入无间地狱的，永无解脱希望，要经受五种无间之苦”，即时无间、空无间、罪器无间、平等无间和生死无间。这是《无间道》中的话，刘建明无法解脱，他内心的挣扎程度很高。他明白自己及时身份不会被发现，但是无间轮回是不可避免的，除非死亡。
而这种结局，更能突出对人性的描写，使得整部电影更加生动，表现出人性最真实的一面。