《告密者》主要讲述公安干警龙飞在偶然的机会下得到有关“告密者”的线索，由此展开调查的故事，故事发生在20世纪50年代，1949年国民党逃离时，在内地安插了大批特务，他们被称为万能潜伏特务，龙飞的任务就是找出他们。
龙飞和鸽子、孔雀、红隼等都曾是地下工作者，为了完成任务，龙飞和鸽子假扮成夫妻，两人在相处过程中逐渐产生深厚情谊，成为革命情侣，好景不长，鸽子、孔雀、红隼等悉数被抓，从那之后，鸽子便神秘失踪，龙飞一直以为鸽子死了。
没想到在调查万能潜伏特务的过程中，很多线索都和鸽子有着千丝万缕的联系，这不禁让龙飞怀疑鸽子究竟是死是活，她有没有叛变，龙飞的调查并不顺利，各种线索时而清晰可见，时而扑朔迷离，让他摸不清头脑。
不过最后他还是查清了真相，原来鸽子早在多年前就遇害身亡，特务们故布疑阵将所有线索都指向鸽子，但实际上，鸽子从未背叛过组织，虽然龙飞揪出了“告密者”，但在“告密者”背后，还有更大的势力等着他们。