上官云顿出现在《武林外传》的第六集中。他是天残派的第一杀手，被派到同福客栈中刺杀小郭，表面和蔼可亲，像个慈祥的老爷爷，但实际上的他心狠手辣，被江湖上的人称为最残忍最没人性的杀手，他杀死的人死相都十分难看。
故事的起因要从杨惠兰的比武招亲说起，杨惠兰被称为寡妇刀手，她一心想要寻找一个如意郎君，入住同福客栈后，李大嘴对她一见钟情，便与白展堂商议，让白展堂陪他演一场戏，如此一来自己便能抱得美人归。
没想到他的计划被小郭破坏了，小郭女扮男装参加比武招亲，将杨惠兰打败后，杨惠兰便全心全意的只想嫁给小郭，知道小郭是女儿身后，感觉被骗了的她一气之下离开同福客栈，利用小郭的名字单挑黑风寨，使小郭成为众矢之的。
为了报复小郭，黑风寨找到江湖上的黑道三大家族，出重金购买小郭的项上人头，于是三大家族分别派出美丽不打折、金银二老和上官云顿，虽然三方势力在江湖上声名显赫，但他们都死在了同福客栈中。
上官云顿是最后一个出场的，他的到来使众人感受到了生命的威胁，就在大家以为必死无疑时，李大嘴将金银二老的夺命蝎扔给上官云顿，他以为是普通暗器，便用手接住了，没想到被夺命蝎咬伤，中毒而死。
剧中虽然没有呈现上官云顿的死状，但从邢捕头的描述中可以听出他死得极惨，全身的皮都被挠没了，江湖上赫赫有名的三大高手都死在同福客栈后，便再也没人敢来找小郭的麻烦，李大嘴则一直生活在对杨惠兰的思念中。